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在生命科學(xué)中，熒光顯微鏡是在光學(xué)顯微鏡的基礎上，對細胞內特異的蛋白質(zhì)、核酸、糖類(lèi)、脂質(zhì)以及某些離子等組分進(jìn)行定性研究的有力工具。

而在植物學(xué)領(lǐng)域內，由于植物細胞有細胞壁，且隨著(zhù)植物的種類(lèi)、細胞的類(lèi)型、植物的生長(cháng)時(shí)間、生長(cháng)狀況及水分含量的差異，細胞壁厚度也會(huì )有很大的變化，且并不像動(dòng)物細胞具有良好的貼壁性，因此用熒光顯微鏡進(jìn)行記號觀(guān)測的運用方式越來(lái)越廣泛。

如今基因工程的相關(guān)理念和試驗技術(shù)也隨著(zhù)科技進(jìn)步日新月異，而作為轉基因研究所繞不過(guò)的植物模式生物——擬南芥，具有植株小、結實(shí)多、周期短，形態(tài)特征分明、自交繁殖，基因組簡(jiǎn)單等諸多優(yōu)勢，大大縮短了基因工程的試驗周期。而熒光顯微具有可特異性標記、可對活體細胞或組織進(jìn)行實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)成像的優(yōu)勢，結合模式生物的特點(diǎn)，能夠更加進(jìn)一步縮短試驗周期，對表達性狀也能進(jìn)行觀(guān)測。